Биоинформатик (single-cell transcriptomics)

Привет! Мы — Open Longevity, международная некоммерческая организация, финансирующая научные исследования в области продления жизни, регенерации и биомедицинских технологий.

Мы запускаем исследовательский проект, посвящённый молекулярным и клеточным механизмам старения, с фокусом на регуляцию белковых сетей и динамику клеточных состояний. Проект основан на анализе single-cell данных (scRNA-seq) и направлен на выявление возраст-зависимых изменений на уровне отдельных клеток.

Проект находится на активной исследовательской стадии, планируется привлечение финансирования от международных и американских научных фондов для его масштабирования и развития.

В команду требуется биоинформатик, который уверенно работает с массивными данными и способен вести аналитическую часть проекта в тесном взаимодействии с молекулярными биологами.

Обязанности:

– Анализ scRNA-seq данных от первичной обработки до биологической интерпретации результатов совместно с экспериментальными биологами

– Работа с публичными датасетами, включая загрузку данных из GEO и других репозиториев

– Построение клеточных траекторий, pseudotime и RNA velocity с последующим обсуждением результатов внутри команды

– Интеграция данных и подготовка аналитических материалов для публикаций и внутренних научных обсуждений

Обязательные требования:

– Уверенное владение R и работа в RStudio

– Опыт работы с публичными репозиториями данных (например, GEO)

– Практический опыт работы с Cell Ranger и стандартными пайплайнами scRNA-seq

– Знание и опыт использования основных пакетов для анализа single-cell данных (Seurat, Scanpy и др.)

– Опыт построения RNA velocity, клеточных траекторий и анализа псевдовремени

– Владение Python-библиотеками для анализа данных (NumPy, Pandas и др.)

– Опыт работы с высокоразмерными биологическими данными

– Умение работать в команде и эффективно взаимодействовать с молекулярными биологами и другими участниками проекта

Желательные требования:

– Понимание биологических механизмов старения

– Опыт работы с данными пространственной транскриптомики (spatial transcriptomics)

Публикации

Обязательным условием является наличие научных публикаций, связанных с single-cell исследованиями, в которых кандидат выступал в роли специалиста, выполнявшего биоинформатический анализ данных.

К рассмотрению также принимаются кандидаты, чьи релевантные работы находятся на стадии рецензирования или были недавно поданы в научные журналы. В этом случае просьба указать такие работы в CV или мотивационном письме с кратким описанием вашей роли в анализе данных.

Условия:

– Частичная занятость (part-time), с возможностью дальнейшего расширения роли по мере развития проекта и привлечения финансирования

– Удаленная работа

– Оплата от 700$ - обсуждается с конечным кандидатом

Просим предоставить мотивационное письмо с описанием того, как ваш опыт соответствует обязательным и желательным требованиям вакансии. Не рассматриваем кандидатов без мотивационного письма.